基于蛋白质结构的多重序列比对的黄金标准评估法:平均相似性法

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基于蛋白质结构的多重序列比对的黄金标准评估法:平均相似性法

康勍, 胡健, 戚兴保, 方慧生, 陈凯先

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康勍, 胡健, 戚兴保, 方慧生, 陈凯先. 基于蛋白质结构的多重序列比对的黄金标准评估法:平均相似性法[J]. 中国药科大学学报, 2009, 40(2): 190-192.

引用本文:

康勍, 胡健, 戚兴保, 方慧生, 陈凯先. 基于蛋白质结构的多重序列比对的黄金标准评估法:平均相似性法[J]. 中国药科大学学报, 2009, 40(2): 190-192.

基于蛋白质结构的多重序列比对的黄金标准评估法:平均相似性法

1.
中国药科大学生命科学与技术学院
2.
上海中医药大学

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出版历程
- 刊出日期: 2009-04-24

摘要: 目的:建立蛋白质多重序列的质量评估法。方法:假定在多重序列比对中的一条序列是未知的,以其他序列作为模板,通过将模板蛋白质的三维结构作为未知蛋白质的预测模型,进而比较预测与实际结构的相似性,将它们的平均值作为多重序列比对的质量。结果:通过SCOP数据库的检验,所得的质量标准与专家分类的标准基本一致。结论:本方法是一种有效的蛋白质多重序列比对的质量评估法。
- 多重序列比对 /
- 评估 /
- 平均相似性法 /
- 蛋白质结构

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