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考布他汀A-4衍生物的设计、合成及其抗肿瘤活性

  • 吴文平
  • 李斯思
  • 马成
新疆医科大学药学院,乌鲁木齐 830011

中图分类号: R914R965

最近更新:2022-06-28

DOI:10.11665/j.issn.1000-5048.20220304

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摘要

以微管蛋白抑制剂考布他汀A-4(CA-4)为先导化合物,通过骨架变换,以苯并咪唑环取代CA-4结构中的B环,并引入不同的取代基,设计合成了8个新化合物,结构经NMR,HRMS表征。通过MTT法测定其对A549、HepG2、HCT-116、MCF-7、PC-3以及Siha等6种肿瘤细胞的增殖抑制作用,利用划痕实验评价了化合物对细胞迁移作用的影响,运用分子对接法分析了活性化合物与微管蛋白及PI3K激酶各亚型的作用方式。结果表明,化合物4e对6种肿瘤细胞表现出较好的增殖抑制活性,尤其对宫颈癌细胞Siha的抑制作用最强(IC50 = 12.18 ± 1.17 μmol/L),且能有效抑制细胞迁移,具有进一步研究的价值。分子对接结果表明,化合物4e与微管蛋白的结合能强于CA-4,与PI3Kδ激酶蛋白相互作用最强,结合能为-37.2 kJ/mol。本研究为基于PI3K与微管蛋白的抗肿瘤药物研究提供了一定的理论依据。

癌症是危害人类健康的重大疾病,传统细胞毒类药物多伴随着选择性差、不良反应大、患者耐受性较差以及长期使用易产生耐药性等缺

1。近年来,小分子靶向药物和生物大分子药物如单克隆抗体等为肿瘤患者提供了有效的治疗方案。但这些药物长期应用也会出现耐药性和不良反应,一般需和细胞毒类药物如紫杉醇等联用以提高疗2-3。因此设计开发选择性高、不良反应低的小分子靶向药物是抗肿瘤药物研究的重点也是难点。PI3Ks激酶主要有α、β、γ和δ 4种亚型, PI3Kα和PI3Kβ分布广泛,可调节有丝分裂和促进代谢调控;PI3Kδ 和PI3Kγ主要发现于白细胞中,参与免疫调节4-5。PI3K/Akt信号通路是癌症发生过程中频繁激活的最重要通路之6,其可调控细胞的生长、增殖、存活和迁移,针对该靶点的抗肿瘤药物研发是极其活跃的领7-9。早期的泛PI3K抑制剂LY294002能逆转肿瘤细胞对化疗的耐药性,构效关系研究发现结构中的吗啉基团对于抑酶活性必不可10-11,吗啉环上氧原子可与Val882残基形成稳定的氢12,在后续药物研发中作为活性基团予以保留。BKM120是双吗啉基嘧啶衍生物,它是一种泛PI3K抑制13。近期的研究显示,BKM120对肿瘤细胞的抗增殖活性并不是通过抑制PI3K而是由微管依赖性细胞毒性所致,并且将BKM120的嘧啶骨架替换为吡啶或三嗪骨架,可分别获得微管去稳定剂(microtubule destabilizing agent, MDA)和PI3K抑制14,该药与紫杉醇联合应用治疗复发性或转移性头颈部鳞状细胞癌的Ⅲ期临床试验正在进行15

  

Figure 1  Chemical structures of PI3K inhibitor LY249002 and BKM120

微管是由α、β两种微管蛋白聚合而成的管状聚合物,在维持细胞形态、细胞运动以及胞内物质运输等发挥重要作用,是抗肿瘤药物研究与开发的重要靶

16。尽管微管靶向药物如紫杉醇、长春碱等在临床上取得了巨大成功,但耐药性和剂量限制性毒性限制了其临床应17-18。考布他汀A-4(CA-4)(图2化合物a),作为天然微管蛋白聚合抑制19,由于水溶性差、生物利用度低及结构不稳定等,临床应用受到限制,但其结构相对简单,较易进行结构改造和修饰而受到研究人员关20-21。课题组前期以CA-4为基础,分别选用呋喃环与咪唑环来修饰桥链结构,结果表明用苯并呋喃环改造的BF12(图2化合物b)对Siha肿瘤细胞表现出良好的抑制作用,进一步研究发现其通过抑制微管聚合和下调PI3K通路中p-p70S6K蛋白表达而发挥作用;但该化合物水溶性不佳且作用弱于CA-4。后以苯并咪唑环修饰CA-4,B环引入芳炔烃基团(图2化合物c),该系列化合物也对多种肿瘤细胞表现出不同程度的增殖抑制活22-24

  

Figure 2  Chemical structures of combretastatin A-4(CA-4) and its derivatives synthesized in previous works

本文以CA-4为先导化合物,在前期研究基础上,以苯并咪唑环替代其B环,利用拼合原理在该骨架中引入丙烯酰胺(酯)基团,经4步反应合成了8个新型化合物,测定了化合物的抗肿瘤活性,分析化合物与作用靶点的结合方式以及构效关系,为开发具有PI3K激酶和微管蛋白双重抑制作用的小分子化合物提供依据。

1 合成路线

合成路线如图3所示,以2-硝基-4氯苯胺为原料经N-碘代丁二酰亚胺(NIS)取代得中间体1,碱性条件下与甲醇发生亲核加成-消除反应生成中间体2,再与3,4,5-三甲氧基苯甲醛经连二亚硫酸钠还原缩合关环生成关键中间体3,最后在双(三苯基膦)二氯化钯(Ⅱ)催化下与不同取代丙烯酰基发生Heck反应得到6-取代2-芳基苯并咪唑类衍生物4a ~ 4b。

  

Figure 3  Synthetic route of combretastatin A-4 derivatives 4a-4h

a: N-Iodosuccinimide, CH3COOH; b: KOH, CH3OH, DMSO; c: Na2S2O4, H2O, DMSO; d: DMF, Et3N, PdCl2(PPh3)2

2 实验部分

2.1 试剂、仪器及细胞

CA-4(上海源叶生物科技有限公司);实验室合成所用试剂及原料药均用市售分析纯商品;培养细胞用DEME、MEM、PBS和胎牛血清均购自以色列Biological Industries公司。

X-4型显微熔点仪(上海精密科学仪器有限公司);Unity-Inova 600 MHz型核磁共振波谱仪(美国Varian公司);Scientific Q Exactive型高分辨质谱仪(美国Thermo公司);SOPTOP型倒置显微镜(宁波舜宇仪器公司);Multiskan GO型全波长酶标仪(美国Thermo公司);200 ~ 300目柱色谱硅胶(青岛海洋化工有限公司)。

人宫颈癌细胞Siha、人结肠癌细胞HCT-116、人前列腺癌细胞PC-3、人肺癌细胞A549、人肝癌细胞HepG2和人乳腺癌MCF-7均由新疆医科大学药学院张伟怡课题组惠赠。

2.2 化学合成

2.2.1 中间体1的合成

将2-硝基-4-氯苯胺2.59 g(15 mmol)与NIS 3.37 g(15 mmol)溶解于乙酸中,升温至50 ℃反应8 h,TLC监测(乙酸乙酯-石油醚,1∶1)至反应完全。反应结束后将其冷却至室温,析出沉淀,抽滤,饱和NaHCO3溶液洗涤,蒸馏水洗涤,干燥,得到橘黄色固体粉末(4-氯-5-碘-2-硝基苯胺)4.96 g,收率83.2%,mp:131.1 ~ 132.6 ℃1H NMR(600 MHz,DMSO-d6δ: 8.34(s,1H,Ph-H),7.58(s,2H,-NH2),7.25(s,1H,Ph-H),与参考文献[

25]一致。产物未经纯化直接进入下一步。

2.2.2 中间体2的合成

将KOH 1.40 g(25 mmol)、中间体1 2.98 g(10 mmol)与甲醇15 mL溶解于DMSO溶液5 mL中,升温至60 ℃反应10 h,TLC监测(乙酸乙酯-石油醚,1∶1)至反应完全。反应结束后取出将其冷却至室温,析出针状沉淀,抽滤,蒸馏水洗涤,干燥,得到黄色固体粉末(4-甲氧基-5-碘-2-硝基苯胺)2.35 g,收率 78.9%,mp:178.9 ~ 180.2 ℃1H NMR(600 MHz,DMSO-d6δ: 8.28(s,1H,Ph-H),7.61(s,2H,-NH2),6.51(s,1H,Ph-H),3.83(s,3H,-OCH3),与参考文献[

25]一致。产物未经纯化直接进入下一步。

2.2.3 中间体3的合[

26]

将中间体2 0.58 g(2 mmol)和3,4,5-三甲氧基苯甲醛0.40 g(2 mmol)与连二亚硫酸钠0.52 g(3 mmol)溶解于DMSO 3 mL中,水浴80 ℃回流4 h,TLC监测(乙酸乙酯-石油醚,2∶1)至反应完全。反应结束后将其冷却至室温,加入大量蒸馏水,析出沉淀,抽滤,滤饼烘干,得到米黄色固体粉末(5-甲氧基-6-碘-2-(3,4,5-三甲氧基苯)-1H-苯并咪唑)0.67 g,收率68.4%,mp:170.1 ~ 172.0 ℃1H NMR(600 MHz,DMSO-d6δ:8.09 (d,J = 4.4 Hz,1H,Ph-H),7.50(d,J = 4.1 Hz,2H,Ph-H),7.22(d,J = 4.2 Hz,1H,Ph-H),3.94 ~ 3.87(m,9H,Ph-OCH3),3.76(s,3H,Ph-OCH3)。产物未经纯化直接进入下一步。

2.2.4 化合物4a(E)-3-(5-甲氧基-2-(3,4,5-三甲氧基苯基)-1H-苯并[d]咪唑-6-基)丙烯酸乙酯的合成

将丙烯酸乙酯0.30 g(3 mmol)、中间体3 0.44 g(1 mmol)、2 mL三乙胺和双(三苯基膦)二氯化钯(Ⅱ) 28.20 mg(0.04 mmol)溶于N,N-二甲基甲酰胺溶液3 mL中,水浴 100 ℃回流12 h,TLC监测(乙酸乙酯-石油醚,5∶1)至反应完全。反应结束后将其冷却至室温,过滤除去钯粉,反应液依次经饱和NaCl溶液与乙酸乙酯萃取3次,合并有机层,无水硫酸镁干燥,过滤,减压蒸除溶剂,粗产物经硅胶柱色谱分离纯化(梯度洗脱石油醚-乙酸乙酯,5∶1 ~ 3∶1;乙酸乙酯-甲醇,5∶1),得浅黄色油状物,收率为51.6%,HRMS(m/z)[M+H+ 413.170 651H NMR(600 MHz,CDCl3-d6δ:8.10(1H,d,J = 16.0 Hz,C=CH-),7.65(1H,s,Ph-H),7.40(2H,s,Ph-H),7.21(1H,s,Ph-H),6.46(1H,d,J = 16.1 Hz,-CH=C),4.28(2H,q,J = 7.2 Hz,-CH2-OOC),3.87 ~ 3.74(12H,m,-OCH313C NMR(150 MHz,CDCl3-d6δ:13.86,55.55,59.95,60.02,60.49,95.73,103.39,116.58,119.66,122.38,124.47,135.59,136.74,139.30,140.50,153.05,153.18,155.34,167.58。

按化合物4a类似的方法分别制备了目标化合物4b ~ 4h,理化性质及光谱数据如下。

2.2.5 化合物4b(E)-3-[(5-甲氧基-2-(3,4,5-三甲氧基苯基)-1H-苯并[d]咪唑-6-基)]-1-(吗啉-4-基)-2-丙烯-1-酮的合成

米白色粉末,收率为34.6%,mp:164.8 ~ 165.7 ℃,HRMS(m/z) [M+H+ 454.197 601H NMR(600 MHz,DMSO-d6δ:13.11(1H,s,Ph-NH),8.19(1H,s,Ph-H),7.94(1H,d,J = 15.3Hz,C=CH-),7.58 (1H,d,J = 4.6 Hz,Ph-H),7.53(1H,d,J = 4.7 Hz,Ph-H),7.03(1H,s,Ph-H),7.20(1H,dd,J = 20.1,15.4 Hz,-CH=C),3.93 ~ 3.88(10H,m,-OCH3),3.73 (5H,d,J = 2.6 Hz,-C4H9NO),3.61(5H,s,-C4H9NO),3.59 ~ 3.54 (2H,m,-C4H9NO)13C NMR(150 MHz,DMSO-d6δ:41.60,45.10,55.40,55.46,55.57,59.66,65.94,99.86,103.21,103.56,109.53,117.18,124.94,124.09,136.76,137.60,138.48,145.58,151.08,152.58,152.69,164.68。

2.2.6 化合物4c(E)-3-(5-甲氧基-2-(3,4,5-三甲氧基苯基)-1H-苯并[d]咪唑-6-基)丙烯酰胺的合成

浅黄色粉末,收率为21.1%,mp:199.2 ~ 201.7 ℃,HRMS(m/z)[M+H+ 384.155 521H NMR(600 MHz,DMSO-d6δ:7.81 ~ 7.76(2H,m,Ph-H,C=CH-),7.68(2H,s,Ph-H),7.19(1H,s,-NH2),7.08(1H,s,Ph-H),6.70(1H,d,J = 16.0 Hz,-CH=C), 3.92 ~ 3.63(12H,m,-OCH313C NMR(150 MHz,DMSO-d6δ:55.54,55.91,59.71,104.27,121.09,121.61,134.20,139.12,148.56,152.77,154.58,166.61。

2.2.7 化合物4d(E)-3-(5-甲氧基-2-(3,4,5-三甲氧基苯基)-1H-苯并[d]咪唑-6-基)-2-甲基丙烯酰胺的合成

橘黄色粉末,收率为15.0%,mp:182.7 ~ 185.4 ℃,HRMS(m/z)[M+H+ 398.170 781H NMR(600 MHz,DMSO-d6δ: 7.90(1H,s,C=CH-),7.67(2H,s,Ph-H),7.44(1H,s,Ph-H),7.17(1H,d,J = 1.9 Hz,Ph-H),6.52(1H,s,-NH2),3.83 ~ 3.34(m, -OCH3),1.95(3H,d,J = 1.6 Hz,-CH313C NMR(150 MHz,DMSO-d6δ:14.79,56.32,56.35,56.35,98.34,115.41,124.59,127.43,131.61,134.73,148.37,148.76,163.75,171.03。

2.2.8 化合物4e(E)-3-(5-甲氧基-2-(3,4,5-三甲氧基苯基)-1H-苯并[d]咪唑-6-基)-N-叔丁基丙烯酰胺的合成

米白色粉末,收率为54.1%,mp:188.7 ~ 189.4 ℃,HRMS(m/z)[M+H+ 440.218 051H NMR(600 MHz,DMSO-d6δ:12.81(1H,s,Ph-NH),7.76 ~ 7.70(1H,m,Ph-H),7.64(1H,d,J = 8.3 Hz,C=CH-),7.50(1H,s,Ph-H),7.47(1H,s,Ph-H),7.04(1H,s,-NH-),6.68(1H,t,J = 16.8 Hz, -CH=C),3.93(6H,s,-OCH3),3.90(6H,s,-OCH3),3.74(2H,s,-OCH3),1.34(8H,s,-CH3); 13C NMR(150 MHz,DMSO-d6δ:28.15,49.63,55.43,55.59,59.67,100.06,103.22,103.44,116.67,119.01,119.61,121.58,133.717,136.23,137.53,152.75,154.39,164.61。

2.2.9 化合物4f(E)-3-(5-甲氧基-2-(3,4,5-三甲氧基苯基)-1H-苯并[d]咪唑-6-基)-N,N-二甲基丙烯酰胺的合成

黄色粉末,收率为33.8%,mp:135.8 ~ 136.2 ℃,HRMS(m/z)[M+H+ 412.186 771H NMR(600 MHz,DMSO-d6δ:12.84(1H,s,Ph-NH),7.87(1H,d,J = 15.5 Hz,Ph-H,C=CH-),7.49(2H,s,Ph-H),7.17(1H,d,J = 15.4 Hz,Ph-H),7.12(1H,s,-CH=C),3.90(10H,d,J = 10.1 Hz, -OCH3),3.73(3H,s,-OCH3),3.17(3H,s,-CH3),2.94(3H,s,-CH313C NMR(150 MHz,DMSO-d6δ:34.85,36.35,55.46,55.55,59.68,103.25,124.82,131.13,136.49,138.98,144.74,152.73,156.90,165.62。

2.2.10 化合物4g(E)-3-(5-甲氧基-2-(3,4,5-三甲氧基苯基)-1H-苯并[d]咪唑-6-基)N-羟甲基丙烯酰胺的合成

橘黄色粉末,收率为24.2%,mp:126.3 ~ 126.6 ℃,HRMS(m/z)[M+H+ 414.165 991H NMR(600 MHz,DMSO-d6δ:12.82(1H,s,Ph-NH),8.66(1H,m,-NH-C=O),7.63(1H,d,J = 6.0 Hz,C=CH-),7.29(1H,d,J = 2.8 Hz,Ph-H),7.03(2H,m,Ph-H),7.00(1H,d,J = 11.5 Hz,Ph-H),6.07(1H,dd,J = 17.2 Hz,-CH=C),4.62(2H,m,-CH2-),3.93(1H,d,J = 3.2 Hz,-OH),3.90 ~ 3.75(12H,m,-OCH313C NMR(150 MHz,DMSO-d6δ:55.41,55.48,55.58,59.68,62.03,100.03,103.21,103.42,116.91,124.95,125.26,129.05,131.43,131.55,137.55,152.75,153.89,154.45,161.80,165.84。

2.2.11 化合物4h(E)-3-(5-甲氧基-2-(3,4,5-三甲氧基苯基)-1H-苯并[d]咪唑-6-基)N-羟乙基丙烯酰胺的合成

橘黄色粉末,收率为65.2%,mp:153.4 ~ 154.1 ℃,HRMS(m/z)[M+H+ 428.181 121H NMR(600 MHz,DMSO-d6δ:8.17(1H,s,-NH-),8.05(1H,t,J = 5.7 Hz,-C=CH-),7.74(1H,s,Ph-H),7.42(1H,d,J = 15.8 Hz,Ph-H),6.64(1H,d,J = 15.8 Hz,-CH=C),6.52(1H,s,Ph-H),4.74(1H,t,J = 5.4 Hz,-OH),3.87(6H,m,-OCH3),3.44(2H,q,J = 5.8 Hz,-CH2-),3.22(2H,q,J = 5.9 Hz,-CH2-)13C NMR(150 MHz,DMSO-d6δ:41.15,55.59,59.47,97.79,113.63,120.56,124.39,125.11,131.51,148.25,162.23,164.93。

2.3 体外抗肿瘤活性

采用MTT法测试目标化合物对6种肿瘤细胞的增殖抑制活性,运用SPSS 25.0软件计算细胞半数抑制浓度(IC50),测试结果见表1

Table 1  Anti-proliferative activity of the CA-4 derivatives 4a-4h against tumor cells(x¯±s, n=3)
Compd.IC50/(μmol/L)
MCF-7PC-3HCT-116SihaHepG2A549
4a 35.56 ± 0.90 61.81 ± 1.22 17.73 ± 2.34 28.61 ± 1.68 34.89 ± 2.30 94.93 ± 8.61
4b 91.54 ± 7.31 75.08 ± 3.47 48.86 ± 1.33 74.20 ± 3.17 >100 >100
4c > 100 85.25 ± 4.50 > 100 > 100 > 100 > 100
4d > 100 > 100 > 100 > 100 > 100 > 100
4e 37.03 ± 0.40 18.88 ± 0.51 18.14 ± 0.45 12.18 ± 1.17 25.28 ± 0.35 36.38 ± 1.29
4f 39.67 ± 0.95 38.44 ± 0.21 26.59 ± 1.16 42.48 ± 0.61 69.20 ± 0.84 > 100
4g > 100 86.25 ± 0.70 81.09 ± 5.13 > 100 > 100 37.66 ± 1.12
4h > 100 > 100 > 100 > 100 > 100 > 100
CA-4 76.59 ± 3.80 75.00 ± 2.80 0.18 ± 0.10 66.02 ± 3.96 > 100 > 100

结果表明,化合物4a、4e和4f对多数肿瘤细胞增殖均表现出较好的抑制作用,化合物4e综合效果最好,对MCF-7、PC-3、HepG2、A549及Siha肿瘤细胞增殖抑制作用强于阳性对照CA-4。

2.4 细胞迁移实验

采用划痕实验探究了Siha细胞用化合物4e给药24 h和48 h后细胞的迁移情况,运用ImagJ 1.8.0软件计算划痕区域面积得到细胞迁移率,运用Graphpad prism绘制柱形图,结果见图4。该实验初步证实化合物4e能有效抑制Siha细胞迁移,且呈浓度与时间依赖性,10 μmol/L浓度处理48 h对细胞迁移抑制作用强于CA-4。

  

Figure 4  Effect of compound 4e on Siha cell migration(x¯±s, n=3

*P < 0.05, **P < 0.01 vs control group

2.5 分子对接研究

本实验选取化合物4e与Ⅰ类PI3K激酶4个亚型α、β、γ和δ及微管蛋白进行对接研究。蛋白晶体结构主要从RCSB Protein Data Bank数据库中获取。蛋白晶体用Pymol软件去除原文件中的水分子和配体,加上极性氢原子和电荷。小分子由 ChemOffice 18.0绘制成3D格式,经MM-2能量优化后保存为“.pdb”格式备用。用AutoDock程序对化合物4e与准备好的蛋白进行分子对接,结合数据如表2,结合构象如图5所示。

Table 2  Basic information of the protein and the lowest binding energy predicted by docking
Name of proteinPDB IDResolution/ÅThe lowest binding energy/(kJ/mol)
Compd. 4eHydrogen bondsCA-4Hydrogen bonds
PI3Kα 4ZOP 2.92 -35.1 2 - -
PI3Kβ 4J6I 2.90 -36.8 1 - -
PI3Kγ 7KKE 2.81 -33.5 4 - -
PI3Kδ 4GB9 2.44 -37.2 2 - -
Tubulin 1SA0 3.58 -31.0 2 -28.0 1

  

Figure 5  Binding of CA-4 or compound 4e with target proteins

A: 4e-PI3Kα; B: 4e-PI3Kβ; C: 4e-PI3Kγ; D: 4e-PI3Kδ; E: 4e-tubulin; F: CA-4-tubulin.The pink parts are small molecule ligands, the blue parts are amino acid residues, and the yellow dotted lines are hydrogen bond interactions

分子对接结果表明,化合物4e与微管蛋白结合能为-33.5 kJ/mol,强于CA-4(-28.0 kJ/mol);化合物4e与PI3K 4个亚型激酶结合中发现,与PI3Kδ蛋白相互作用最强,结合能为-37.2 kJ/mol。该结果与细胞活性实验相吻合。

化合物4e中三甲氧基苯基在与PI3Kβ、PI3Kγ、PI3Kδ蛋白结合时占据了共同的疏水腔,疏水腔由Phe694、Phe698氨基酸残基构成。化合物4e中咪唑环上的N或-NH均可与PI3K 4种亚型蛋白形成氢键相互作用,苯并咪唑环的存在可能有利于固定3,4,5-三甲氧基苯基占据疏水腔从而产生相互作用。此外,苯并咪唑环还分别与PI3Kβ、PI3Kδ蛋白中的Asp788氨基酸残基形成了π-cation相互作用,进一步增强与激酶的结合作用。化合物4e与微管蛋白的氢键作用数比CA-4多。

3 讨 论

分析化合物的构效关系发现,酰胺氮原子上的取代基对活性有较大影响,当叔丁基取代(4e)时,化合物对癌细胞的抑制作用最强;当N,N-二甲基取代(4f)时,化合物活性下降;而羟甲基、羟乙基取代(4g,4h)或未取代(4c,4d)时,化合物活性很弱。吗啉基取代的4b在本次实验中仅对结肠癌细胞表现出一定的活性,其在母核中的取代位置有待于进一步探索。化合物4a在部分肿瘤细胞增殖中亦表现出较好活性。细胞迁移实验初步证实,4e能有效抑制Siha细胞迁移,且呈浓度与时间依赖性。化合物4e与微管蛋白及PI3K激酶的分子对接结果为进一步活性验证实验提供了参考。

4 结 论

本文以微管蛋白抑制剂CA-4为先导化合物,结合前期研究基础,以苯并咪唑取代B环,在5位引入取代丙烯酰胺(酯)基团,设计合成了8个新型CA-4类衍生物。体外抗肿瘤活性筛选表明,以N-叔丁基取代的化合物4e对MCF-7、PC-3、HepG2、A549及Siha 5种肿瘤细胞的抑制作用优于CA-4。划痕实验显示化合物4e可抑制Siha细胞迁移,为CA-4类似物的结构修饰与活性优化提供了思路。

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