摘要
以微管蛋白抑制剂考布他汀A-4(CA-4)为先导化合物,通过骨架变换,以苯并咪唑环取代CA-4结构中的B环,并引入不同的取代基,设计合成了8个新化合物,结构经NMR,HRMS表征。通过MTT法测定其对A549、HepG2、HCT-116、MCF-7、PC-3以及Siha等6种肿瘤细胞的增殖抑制作用,利用划痕实验评价了化合物对细胞迁移作用的影响,运用分子对接法分析了活性化合物与微管蛋白及PI3K激酶各亚型的作用方式。结果表明,化合物4e对6种肿瘤细胞表现出较好的增殖抑制活性,尤其对宫颈癌细胞Siha的抑制作用最强(IC50 = 12.18 ± 1.17 μmol/L),且能有效抑制细胞迁移,具有进一步研究的价值。分子对接结果表明,化合物4e与微管蛋白的结合能强于CA-4,与PI3Kδ激酶蛋白相互作用最强,结合能为-37.2 kJ/mol。本研究为基于PI3K与微管蛋白的抗肿瘤药物研究提供了一定的理论依据。
关键词
癌症是危害人类健康的重大疾病,传统细胞毒类药物多伴随着选择性差、不良反应大、患者耐受性较差以及长期使用易产生耐药性等缺

Figure 1 Chemical structures of PI3K inhibitor LY249002 and BKM120
微管是由α、β两种微管蛋白聚合而成的管状聚合物,在维持细胞形态、细胞运动以及胞内物质运输等发挥重要作用,是抗肿瘤药物研究与开发的重要靶

Figure 2 Chemical structures of combretastatin A-4(CA-4) and its derivatives synthesized in previous works
本文以CA-4为先导化合物,在前期研究基础上,以苯并咪唑环替代其B环,利用拼合原理在该骨架中引入丙烯酰胺(酯)基团,经4步反应合成了8个新型化合物,测定了化合物的抗肿瘤活性,分析化合物与作用靶点的结合方式以及构效关系,为开发具有PI3K激酶和微管蛋白双重抑制作用的小分子化合物提供依据。
合成路线如

Figure 3 Synthetic route of combretastatin A-4 derivatives 4a-4h
a: N-Iodosuccinimide, CH3COOH; b: KOH, CH3OH, DMSO; c: Na2S2O4, H2O, DMSO; d: DMF, Et3N, PdCl2(PPh3)2
CA-4(上海源叶生物科技有限公司);实验室合成所用试剂及原料药均用市售分析纯商品;培养细胞用DEME、MEM、PBS和胎牛血清均购自以色列Biological Industries公司。
X-4型显微熔点仪(上海精密科学仪器有限公司);Unity-Inova 600 MHz型核磁共振波谱仪(美国Varian公司);Scientific Q Exactive型高分辨质谱仪(美国Thermo公司);SOPTOP型倒置显微镜(宁波舜宇仪器公司);Multiskan GO型全波长酶标仪(美国Thermo公司);200 ~ 300目柱色谱硅胶(青岛海洋化工有限公司)。
人宫颈癌细胞Siha、人结肠癌细胞HCT-116、人前列腺癌细胞PC-3、人肺癌细胞A549、人肝癌细胞HepG2和人乳腺癌MCF-7均由新疆医科大学药学院张伟怡课题组惠赠。
将2-硝基-4-氯苯胺2.59 g(15 mmol)与NIS 3.37 g(15 mmol)溶解于乙酸中,升温至50 ℃反应8 h,TLC监测(乙酸乙酯-石油醚,1∶1)至反应完全。反应结束后将其冷却至室温,析出沉淀,抽滤,饱和NaHCO3溶液洗涤,蒸馏水洗涤,干燥,得到橘黄色固体粉末(4-氯-5-碘-2-硝基苯胺)4.96 g,收率83.2%,mp:131.1 ~ 132.6 ℃
将KOH 1.40 g(25 mmol)、中间体1 2.98 g(10 mmol)与甲醇15 mL溶解于DMSO溶液5 mL中,升温至60 ℃反应10 h,TLC监测(乙酸乙酯-石油醚,1∶1)至反应完全。反应结束后取出将其冷却至室温,析出针状沉淀,抽滤,蒸馏水洗涤,干燥,得到黄色固体粉末(4-甲氧基-5-碘-2-硝基苯胺)2.35 g,收率 78.9%,mp:178.9 ~ 180.2 ℃
将中间体2 0.58 g(2 mmol)和3,4,5-三甲氧基苯甲醛0.40 g(2 mmol)与连二亚硫酸钠0.52 g(3 mmol)溶解于DMSO 3 mL中,水浴80 ℃回流4 h,TLC监测(乙酸乙酯-石油醚,2∶1)至反应完全。反应结束后将其冷却至室温,加入大量蒸馏水,析出沉淀,抽滤,滤饼烘干,得到米黄色固体粉末(5-甲氧基-6-碘-2-(3,4,5-三甲氧基苯)-1H-苯并咪唑)0.67 g,收率68.4%,mp:170.1 ~ 172.0 ℃
将丙烯酸乙酯0.30 g(3 mmol)、中间体3 0.44 g(1 mmol)、2 mL三乙胺和双(三苯基膦)二氯化钯(Ⅱ) 28.20 mg(0.04 mmol)溶于N,N-二甲基甲酰胺溶液3 mL中,水浴 100 ℃回流12 h,TLC监测(乙酸乙酯-石油醚,5∶1)至反应完全。反应结束后将其冷却至室温,过滤除去钯粉,反应液依次经饱和NaCl溶液与乙酸乙酯萃取3次,合并有机层,无水硫酸镁干燥,过滤,减压蒸除溶剂,粗产物经硅胶柱色谱分离纯化(梯度洗脱石油醚-乙酸乙酯,5∶1 ~ 3∶1;乙酸乙酯-甲醇,5∶1),得浅黄色油状物,收率为51.6%,HRMS(m/z)[M+H
按化合物4a类似的方法分别制备了目标化合物4b ~ 4h,理化性质及光谱数据如下。
2.2.5 化合物4b(E)-3-[(5-甲氧基-2-(3,4,5-三甲氧基苯基)-1H-苯并[d]咪唑-6-基)]-1-(吗啉-4-基)-2-丙烯-1-酮的合成
米白色粉末,收率为34.6%,mp:164.8 ~ 165.7 ℃,HRMS(m/z) [M+H
浅黄色粉末,收率为21.1%,mp:199.2 ~ 201.7 ℃,HRMS(m/z)[M+H
橘黄色粉末,收率为15.0%,mp:182.7 ~ 185.4 ℃,HRMS(m/z)[M+H
米白色粉末,收率为54.1%,mp:188.7 ~ 189.4 ℃,HRMS(m/z)[M+H
黄色粉末,收率为33.8%,mp:135.8 ~ 136.2 ℃,HRMS(m/z)[M+H
橘黄色粉末,收率为24.2%,mp:126.3 ~ 126.6 ℃,HRMS(m/z)[M+H
橘黄色粉末,收率为65.2%,mp:153.4 ~ 154.1 ℃,HRMS(m/z)[M+H
采用MTT法测试目标化合物对6种肿瘤细胞的增殖抑制活性,运用SPSS 25.0软件计算细胞半数抑制浓度(IC50),测试结果见
结果表明,化合物4a、4e和4f对多数肿瘤细胞增殖均表现出较好的抑制作用,化合物4e综合效果最好,对MCF-7、PC-3、HepG2、A549及Siha肿瘤细胞增殖抑制作用强于阳性对照CA-4。
采用划痕实验探究了Siha细胞用化合物4e给药24 h和48 h后细胞的迁移情况,运用ImagJ 1.8.0软件计算划痕区域面积得到细胞迁移率,运用Graphpad prism绘制柱形图,结果见

Figure 4 Effect of compound 4e on Siha cell migration()
*P < 0.05,
本实验选取化合物4e与Ⅰ类PI3K激酶4个亚型α、β、γ和δ及微管蛋白进行对接研究。蛋白晶体结构主要从RCSB Protein Data Bank数据库中获取。蛋白晶体用Pymol软件去除原文件中的水分子和配体,加上极性氢原子和电荷。小分子由 ChemOffice 18.0绘制成3D格式,经MM-2能量优化后保存为“.pdb”格式备用。用AutoDock程序对化合物4e与准备好的蛋白进行分子对接,结合数据如

Figure 5 Binding of CA-4 or compound 4e with target proteins
A: 4e-PI3Kα; B: 4e-PI3Kβ; C: 4e-PI3Kγ; D: 4e-PI3Kδ; E: 4e-tubulin; F: CA-4-tubulin.The pink parts are small molecule ligands, the blue parts are amino acid residues, and the yellow dotted lines are hydrogen bond interactions
分子对接结果表明,化合物4e与微管蛋白结合能为-33.5 kJ/mol,强于CA-4(-28.0 kJ/mol);化合物4e与PI3K 4个亚型激酶结合中发现,与PI3Kδ蛋白相互作用最强,结合能为-37.2 kJ/mol。该结果与细胞活性实验相吻合。
化合物4e中三甲氧基苯基在与PI3Kβ、PI3Kγ、PI3Kδ蛋白结合时占据了共同的疏水腔,疏水腔由Phe694、Phe698氨基酸残基构成。化合物4e中咪唑环上的N或-NH均可与PI3K 4种亚型蛋白形成氢键相互作用,苯并咪唑环的存在可能有利于固定3,4,5-三甲氧基苯基占据疏水腔从而产生相互作用。此外,苯并咪唑环还分别与PI3Kβ、PI3Kδ蛋白中的Asp788氨基酸残基形成了π-cation相互作用,进一步增强与激酶的结合作用。化合物4e与微管蛋白的氢键作用数比CA-4多。
分析化合物的构效关系发现,酰胺氮原子上的取代基对活性有较大影响,当叔丁基取代(4e)时,化合物对癌细胞的抑制作用最强;当N,N-二甲基取代(4f)时,化合物活性下降;而羟甲基、羟乙基取代(4g,4h)或未取代(4c,4d)时,化合物活性很弱。吗啉基取代的4b在本次实验中仅对结肠癌细胞表现出一定的活性,其在母核中的取代位置有待于进一步探索。化合物4a在部分肿瘤细胞增殖中亦表现出较好活性。细胞迁移实验初步证实,4e能有效抑制Siha细胞迁移,且呈浓度与时间依赖性。化合物4e与微管蛋白及PI3K激酶的分子对接结果为进一步活性验证实验提供了参考。
本文以微管蛋白抑制剂CA-4为先导化合物,结合前期研究基础,以苯并咪唑取代B环,在5位引入取代丙烯酰胺(酯)基团,设计合成了8个新型CA-4类衍生物。体外抗肿瘤活性筛选表明,以N-叔丁基取代的化合物4e对MCF-7、PC-3、HepG2、A549及Siha 5种肿瘤细胞的抑制作用优于CA-4。划痕实验显示化合物4e可抑制Siha细胞迁移,为CA-4类似物的结构修饰与活性优化提供了思路。
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